Forskere fra Kina og Tyskland har for første gang fullstendig tydet potetgenomet, melder TASS. Dette hjalp dem med å avdekke plantens evolusjonshistorie og identifisere nøkkeldeler av DNA assosiert med vekst og sykdomsresistens. Informasjon om dette ble publisert av pressetjenesten til German Institute of Plant Breeding (IPZ).
"Å forstå potetgenomet vil tillate oss å lansere svært effektive avlsprogrammer som vil skape nye varianter som er både høyavkastende og motstandsdyktige mot global oppvarming, noe som vil være kritisk i de kommende tiårene," sa IPZ-professor Korbinian Schneeberger.
Potetdyrking er hemmet av mange sopp- og bakteriesykdommer, samt ulike skadedyr, som Colorado-potetbille og nematoder. Forskere og oppdrettere prøver å bekjempe dem ved å lage nye varianter av vanlige og genmodifiserte poteter.
Professor Schneeberger og hans kolleger har fått en potensiell løsning på dette problemet som en del av et storstilt prosjekt som tar sikte på å fullstendig tyde potetgenomet. Tidligere har forskere allerede forsøkt å få tak i denne informasjonen, men dette ble hemmet av den ekstremt komplekse strukturen til potetgenomet - den består av fire identiske sett med kromosomer som inneholder et stort antall repetisjoner.
Nye DNA-sekvenseringsteknologier og algoritmer for å analysere genetisk informasjon hjalp tyske og kinesiske genetikere med å løse dette problemet for Otava-varianten. For å tyde genomet samlet forskerne et stort antall pollenkorn, hvis genetiske materiale inneholder bare to, i stedet for fire, kopier av kromosomer.
Denne tilnærmingen forenklet oppgaven betraktelig, men samtidig krevde den dechiffrering av et veldig stort antall DNA-fragmenter og deres påfølgende kombinasjon ved hjelp av dataalgoritmer. Til slutt fikk forskere en virtuell kopi av det komplette potetgenomet, som består av omtrent 3,1 milliarder genetiske "bokstaver"-nukleotider og inneholder over 38 tusen gener.
Etterfølgende analyse av deres struktur avslørte den komplekse evolusjonshistorien til poteten. Forskere har oppdaget at denne avlingen relativt nylig opplevde genomdobling som et resultat av innavl. I tillegg avdekket forskerne uvanlige forskjeller i aktivitetsnivåene til kopier av de samme genene lokalisert på forskjellige kromosomer, noe som potensielt kan påvirke effektiviteten av å krysse forskjellige potetsorter.
Denne informasjonen, håper forskerne, vil bidra til å utvikle nye varianter eller modifisere genomet slik at poteter vil vokse raskere, bedre motstå sensyke og andre sykdommer, og vil også være mindre utsatt for ulike stressfaktorer.